C’est une erreur assez énervante, je l’ai à chaque fois que je fais un truc un peu long sur un de mes sites internet, à chaque fois je passe 30 minutes à trouver la solution !

Pourtant c’est très simple ! Si vous avez Webmin, il faut aller dans Serveurs -> Serveur Web Apache. Choisir le site en question et cliquer sur Serveur virtuel. Ensuite cliquer sur Edition des directives et chercher la ligne qui commence par : IPCCommTimeout. Vous mettez ce que vous voulez après, c’est la durée que va prendre au maximum une requête en seconde.

Enfin appliquer et le tour est joué !

Source : http://rickchristie.com/blog/2011/note/apache-mod_fcgid-read-data-timeout-error/